مرتضی آقاعلیخانی در نخستین روز، نخستین ماه سال ۱۳۴۲ در روستای خیارج از توابع شهرستان بوئین زهرا در خانواده مذهبی و عاشق اهل بیت علیهم السلام به دنیا آمده و دوران کودکی را در روستا طی کرد. وی که درس خود، در مقاطع ابتدایی تا پایان دوره ی متوسطه را به خوبی و با موفقیت در شهرستان قزوین و کرج سپری کرده بود پس از اخذ مدرک دیپلم به خدمت مقدس سربازی اعزام گردید.

مرتضی که در صحنه های مختلف انقلاب و بعد از آن حضوری موثر و مستمر داشت پس از خدمت حدود ۷ ماه در ارتش جمهوری اسلامی و حضور ۴ ماهه در جبهه های نبرد، موفق به قبولی در کنکور سراسری و قبولی در دانشگاه کشاورزی زنجان شده و به ادامه ی تحصیل در دانشکده کشاورزی زنجان پرداخت.

او که توان تحمل فشارهای تحمیلی جنگ بر مردم شریف و عزیز خود را نداشت سرانجام به بسیج مراجعه و در سال روز پیروزی انقلاب اسلامی، روز ۲۲ بهمن ماه سال ۱۳۶۱ پرسشنامه را جهت حضور مجدد در جبهه های نبرد حق علیه باطل پر و امضاء کرد.

مرتضی آقاعلیخانی در دوران تحصیل خود در دانشگاه نیز با حضور در جهاد دانشگاهی به عضویت بخش فرهنگی این نهاد درآمده و در فعالیت های جمعی دانشجویان در جهت حفظ دستاوردهای انقلاب و ارزش های نظام تلاش کرد.

او سرانجام در درگیری با دشمن انقلاب و ایران اسلامی، پس از ماه ها مبارزه با مزدوران استکبار جهانی، روز ۲۴ اردیبهشت ماه سال ۱۳۶۵ در منطقه فاو در عملیات والفجر ۸ به شهادت رسید و پیکر پاک و مطهرش در زادگاهش روستای خیارج به خاک سپرده شد.